Hola Mario,
mi nombre es Miguel Barreda, soy realizador y editor, afincado entre Arequipa y Alemania (Berlín). Disculpa el abuso de confianza, pero me dio gusto encontrar a alguien de Perú aquí en el foro.
Respecto a tu consulta, CREO que FCP lo puede corregir, yo estoy tratando un asunto parecido, pues estoy trabajando en un proyecto NTSC pero grabando con mi cámara PAL, así que convierto de norma con el software y hasta el momento los resultados se dejan ver, mejor dicho, al cliente no le molesta y a mí no demasiado. (ver tema) El paso de DF a NDF es algo similar... De todas formas si no te parecen correctos los resultados, tendrás que hacer un batch capture.
Si te parece, podemos estar en contacto para lo que se ofrezca.. Saludos,
Miguel