¿Desaparece disco externo, cámara? Aplica Repair Permissions (con Disk Utility) al disco que tiene el SO. Y Disk Repair a los discos externos. Si el problema se limita al uso de FCP, desecha las Prefs.
Para FCP 5.1, los pasos son:
User>Library>Preferences> Saca y pon en el basurero "com.apple.FinalCutPro.plist". De la carpeta "Final Cut Pro User Data Folder" saca "Final Cut Pro Obj Cache" y "Final Cut Pro Prof Cache'.
¡Buena suerte!