Una vez que tienes los fragmentos en tu máquina guardados yo sólo he tenido que importarlos desde FCP para poder usarlos en montajes con otros materiales gradados en DVPAL. (La bajada de internet a la compu la hice desde [
keepvid.com])
Pero si lo que no te permite es importar o ponerlas en la timeline junto con otro material debe ser a causa de que son dos tipos de formatos diferentes. Lo que puedes hacer es utilizar Compressor para convertir esos videos de youtube que deben ser .mov al formato del material con el que lo quieras mezclar en FCP.
Si ese no el problema explica un poco mas con detalle que es lo que no puedes hacer.
suerte!